Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms