Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
C9orf92A6NGG3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms