Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MEIS3P1A6NDR6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms