Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL33A6NCF5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms