Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XIRP2A4UGR9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XIRP2A4UGR9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms