Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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