Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A3GALT2U3KPV4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms