Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CHTOPQ9Y3Y2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms