Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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HCN4Q9Y3Q4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HCN4Q9Y3Q4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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