Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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SH3BP1Q9Y3L3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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