Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NINLQ9Y2I6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NINLQ9Y2I6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms