Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP24Q9UPU5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP24Q9UPU5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms