Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AGAP1Q9UPQ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AGAP1Q9UPQ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AGAP1Q9UPQ3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AGAP1Q9UPQ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms