Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PACSIN2Q9UNF0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PACSIN2Q9UNF0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms