Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DENND2AQ9ULE3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms