Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIKQ9UKE5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIKQ9UKE5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms