Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED13Q9UHV7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms