Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFIP11Q9UBB9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms