Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HIGD1BQ9P298 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HIGD1BQ9P298 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms