Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHMP5Q9NZZ3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms