Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
UTP6Q9NYH9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP6Q9NYH9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms