Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJB4Q9NTQ9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJB4Q9NTQ9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms