Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDREJQ9NTG1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKDREJQ9NTG1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms