Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEPEQ9NQ76 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms