Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRIP3Q9NQ35 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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