Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FZD3Q9NPG1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms