Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A4GALTQ9NPC4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms