Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CLMPQ9H6B4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLMPQ9H6B4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms