Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDGFDQ9GZP0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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