Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF407Q9C0G0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms