Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CIPCQ9C0C6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIPCQ9C0C6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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