Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABARAPL3Q9BY60 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms