Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SALL3Q9BXA9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms