Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MESP1Q9BRJ9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms