Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM83CQ9BQN1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms