Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GPR78Q96P69 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GPR78Q96P69 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms