Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLMNQ96JQ2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLMNQ96JQ2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms