Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DCHS1Q96JQ0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms