Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPNQ96H22 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CENPNQ96H22 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms