Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC11Q96DB2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms