Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RUNDC1Q96C34 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNDC1Q96C34 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms