Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SMARCE1Q969G3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMARCE1Q969G3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms