Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSR2Q969E8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms