Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHMTQ93088 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms