Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF439Q8NDP4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF439Q8NDP4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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