Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG16L2Q8NAA4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms