Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms