Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SVOPQ8N4V2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms