Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHCHD4Q8N4Q1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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