Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNMB4Q86W47 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms